Su cometido consiste precisamente en gestionar el apoyo logístico que requieran las unidades desplegadas en todas las operaciones que se desarrollan fuera del territorio español. La labor de este equipo afecta, en consecuencia, a todas las misiones internacionales en las que España participa. Además, no solo coordina y apoya a las tropas desde su sede, sino que es frecuente que algunos de sus especialistas actúen también sobre el terreno. De hecho, personal adscrito a este servicio está ahora mismo desplegado en las misiones que las Fuerzas Armadas españolas desarrollan en Afganistán y en el Líbano.
Entre las razones que han avalado el traslado de esta jefatura a Galicia no ha tenido poco peso el hecho de que desde el año 2005 pasó a depender del Jefe de la Fuerza Logística Operativa (FLO), cuyo cuartel general se encuentra precisamente en A Coruña. De la FLO dependen también la Brigada Logística con sede en Zaragoza y la Brigada de Sanidad, ubicada en la localidad madrileña de Pozuelo de Alarcón.
Otro factor que ha pesado a la hora de decidir el traslado del JALOG-OP a la comunidad gallega ha sido el proceso de reorganización que el Ministerio de Defensa ha emprendido con el fin de racionalizar su estructura y sus infraestructuras. Dentro de este programa de actuaciones, cuya implantación, según las previsiones, se prolongará hasta el año 2017, están programados otros traslados, como el que llevará la sede de la Delegación de Defensa en Galicia, ahora en otro edificio coruñés, al mismo acuartelamiento de Atocha en el que se instalará la Jefatura de Apoyo Logístico. Asimismo, está previsto el cierre de varios servicios militares en todo el territorio español, algunos de ellos asentados en la comunidad gallega. El Ministerio de Defensa prevé ahorrar, con la puesta en marcha de todas esas medidas, 15 millones de euros de sus presupuestos cada año.
El destacamento se encargará de gestionar el apoyo logístico a las operaciones.
El equipo depende desde el 2005 de la Fuerza Logística Operativa, también en A Coruña.